Como assim o que fazer?
Se está falando do momento de instalação, você não deve fazer nada com eles!..
Pois eles servem para instalação do teu server L2JOneo.
Para você instalar um L2JOneo, você tem que executar o DB_Install..
este presente na pasta tools da pasta do teu Server.
Mas.. na hora de executar, não esqueça de configurar o arquivo vars.txt.